El Pabellón Nacional de la Biodiversidad depende de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), es único en su tipo debido a que conjuga las funciones de museo y de investigación. Fue donado por la Fundación Slim. En las áreas de investigación están resguardadas las cuatro colecciones nacionales de vertebrados (es decir: peces, anfibios y reptiles, aves y mamíferos) y la Colección de Maderas, constituidas por 130 mil especímenes en total.

Este espacio tiene como fin divulgar el archivo de millones de piezas, entre insectos, mariposas y plantas de la colección de la UNAM, así como un archivo histórico con documentos sobre diversidad biológica que van del siglo XIX a la actualidad, que alberga el Instituto de Biología de la misma institución, a través de seis salas de exposiciones permanentes y una de exposiciones temporales. Cuenta con seis salas de exposiciones permanentes en las que se abordan distintos temas relacionados con la biodiversidad.

Megadiversidad: Mapa Interactivo, cartucho de especies endémicas, línea de tiempo Instituto de Biología. Sala dedicada a la historia biológica, geográfica y climática de México. Es un espacio que propicia el análisis de los procesos y patrones que causan la diversificación de la vida.

Árbol de la vida: Dioramas Interactivos. Sala dedicada a estudiar la procedencia de cada especie, así como la relación que mantienen con sus ancestros y con otras especies. Este espacio ofrece información sobre la diversidad de grupos biológicos existentes.

Planeta Vivo: Quiz Naturalistas y Micro evolución. En esta sala se estudia la evolución del pensamiento científico dedicado al estudio de la naturaleza. Este espacio nos acerca a los procesos como la filogenia y se muestran las evidencias para el estudio de las relaciones evolutivas de la biodiversidad.

Biolaboratorio: ADN Ambiental y Microscopía. Esta sala está pensada para observar a la ciencia en acción. El protagonista es el quehacer científico de los biólogos y la importancia que tienen en distintos sectores sociales. Además, descubrirás el mundo microscópico y las colecciones que alberga el Instituto de Biología.

Huella ecológica: Limites planetarios y socioecosistemas. El tema principal de esta sala es la conservación. Aquí se exhiben algunas de las problemáticas que se viven en los ecosistemas, además de presentar las amenazas que sufre la biodiversidad a causa del consumo humano y los desastres naturales.

Bio – Eco: Ciudades sostenibles. En esta sala se plantean estrategias para la conservación de la biodiversidad mexicana, así como proyectos en los que los ciudadanos mexicanos pueden participar.

Sonorama: Sala de proyección 5.1 Canales